bLAST Program
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O programa bLAST (Basic Local Alignment Search Tool) é uma ferramenta bioinformática extremamente utilizada para alinhamento de sequências de dados genômicos, transcriptômicos e proteômicos. No território das chamadas "OMICS", constitui uma das ferramentas de análise mais utilizadas por uma vasta gama de profissionais tais como biólogos, computólogos, biologistas moleculares, geneticistas, químicos e, obviamente, bioinformatas. O programa busca determinar heuristicamente sequências de DNA, RNA ou proteínas que possuam um patamar escolhido de similaridade e que, portanto, possam ser analisadas em termos de homologia. A saída (OUTPUT) dos vários módulos de BLAST disponíveis, tanto via Web quanto para uso local (versões do tipo "StandAlone") pode revelar se sequências escolhidas estão aparentadas evolutivamente e pode sugerir também compartilhamento de função biológica através de um processo denominado Anotação. Este processo consiste na determinação de classes e de identidades estabelecidas em Bancos de Dados populados com sequências de função pré-determinada. Embora o BLAST, em si, não seja capaz de anotar os dados, ele permite que se escolha o Banco de Dados a ser utilizado em uma busca sistemática. O indivíduo interessado em proceder um alinhamento utilizando o programa determina, então, o banco de sua escolha, devendo formatar as sequências do Banco de Dados utilizado antes de realizar o alinhamento, no caso de estar utilizando versões do tipo "StandAlone". É muito importante, portanto, conhecer - na linguagem mais utilizada entre bioinformatas - "contra quem está-se 'blastando' a(s) sequência(s) de entrada (INPUT)", ou seja, conhecer bem o Banco de Dados utilizado no alinhamento com o BLAST. A melhor forma de se utilizar o programa através da Internet é acessar o site do NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/), que significa Centro Nacional de Informação em Biotecnologia - em inglês: National Center for Biotechnology Information - e procurar o Link BLAST no cabeçalho da página. E muito bom proveito. Eduardo Righi Capanema.
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